2002年福清市企业科技创新和技术改造力度加大，产学研结合更加紧密，年内有5家高新技术企业通过省级认定，8家企业通过省名牌企业初审，通过ISO9000系列质量体系认证的企业增加到116家，提前两年实现“十五”期间通过认证100家的目标。实施星火计划的项目41项，重点扶持食品、塑胶、机械、化工企业开展科技创新和高新技术研发，部分企业获福州市级以上科技奖项。
  2004年福清市支柱行业、龙头企业规模快速壮大，科技创新能力进一步增强，产业链条更加完善，冠捷、捷联启动全省首家大型企业技术研发中心建设，福耀浮法玻璃第一条生产线顺利投产。质量立市战略深入实施，出台了相关奖励扶持政策，新增2个国家免检产品、3个省名牌产品，福耀玻璃成为福州市首批中国名牌产品。企业科技创新力度加大，产学研结合更加紧密，亚通公司成立了我市首个国家级博士后科研工作站，同时全市荣获全国科技进步示范县（市）称号。
  2005年福清市认真组织实施各级科技计划项目，有12个项目列入福州市级以上科技计划项目和福州市中小企业创新基金项目，其中国家级和省级各2个，共获得支持资金359万元；组织实施市级科技计划项目65项，全市投入科技三项费用999万元。科技进步考核工作顺利通过国家科技部验收，新增2家省级高新技术企业，天生林艺被授予全国科普教育基地称号，亚通、福耀被列入省知识产权试点企业。大力推进科技创新工程，累计实施科技计划项目401项，总投资10.53亿元，有29家企业获评省级以上高新技术企业，高新技术产值占工业总产值的比重由2000年的27.2%增至2005年的61.3%。
  2006年福清市科技创新、品牌强市工作成效显著，新增省级以上高新技术企业11家，其中国家级2家，国家级企业技术中心和博士后科研工作站各1个，中国名牌3个，省名牌和省著名商标35个，荣获全国质量立市先进县（市）称号。
  2007年全市自主创新综合评价指标位居全国县级城市第11位，荣膺“优秀创新型城市”称号，并连续六届被评为全国科技进步先进县（市）。完善科技发展配套政策，认真组织实施各级科技计划项目，被科技部列为科技富民强县专项行动计划试点县市，有19个项目获得省、福州市科技专项资金扶持，总金额达830万元。